• SRA Toolkit (NCBI)
• BWA-MEM
• STAR
• SAMTools
• HTSeq
• DeSeq
• FastQC i MultiQC

riskassessment.icradev.cat

• lcorominas ecam (IWA, GIZ)
• lcorominas, vacuña, jcomas ecoadvisor (ACA, Global Omnium)
• lcorominas, ogutierrez innowatt (ICRA)

• sistema FTP
  • comentar amb afreixa reunió 30ABR
  • fer funcionar correctament
• mesocosmos live
  • comentar amb afreixa reunió 30ABR
  • receptes automàtiques (lògica)
  • (futur) disseny interfície

• [2024-01-10] nros: Tractament estadístic dades multivariants (PCA + ANOVA). Aprofitar plataforma waterdom.
• [2024-02-19] apedregal: Ajuda análisis estadístic (data.csv i pdf explicació mail)
• [2024-03-07] lbosch: Plataforma dedicada per anàlisi automàtic de dades amb estructura "n+m" columnes on "n factors", "m response variables" (anova.icradev.cat)
• comentar plataforma anova amb vicenç per fer difusió/seminari a icra

• Canviar part interpolació
• Calcular llindras a 5% i 1% per tenir tres franjes (verd, groc, vermell)
• Fer diccionari de scores per data on cada data és una pca diferent
• [2024-04-29] josep graficarà amb R segons JSON enviat
• enviat

• Recollir ordinador Fontajau
• Tractament de dades 2023 any sencer (optimizació potències)
• rebre documents pdf xavier agustí (ajuntament girona)

• sim changed
• internet working in router
• static ip sim card
  • dynamic dns configuration
  • get public ip through NAT
  • contractar ip fixa (mriva contacta amb agència catalana habitatge, esperant resposta)
  • CTTI diu "la línia 673006415 té configurada la ip fixe 81.60.233.7"

• cutadapt
• spades
• skesa
• quast
• pgap
  • comprovar container (docker://ncbi/pgap_2023-10-03.build7061)

• esperar sbusquets demani ajuda

• esperar xavi demani ajuda i/o preguntar status

• Reunió amb DSET + Eduard (parc manteniment)
• Carpeta "htdocs/segmentacio-kwh". Provar llibreria knx (npm install knx) (npmjs.com/package/knx)
• reunió dia 3 Abr
• reunió 10ABR isanchez+eduard
• esperar dvila(DSET) i eduard(PARC) executin segons el parlat a la reunió
• sigfox HTTP REST API (https://support.sigfox.com/apidocs)

• login investigadors ICRA
  • provar ssh tunel (funciona)
• esperar vrocasalva, cgutierrez demanin ajuda

• comprar Relé de 220V-AC, 30V-DC, activable amb senyal de 5V
• o bé comprar transistor MOSFET de 24V, activable amb senyal de 5V
• trobada botiga a girona (BTS electrònica, Carrer de Valladolid, 7, 17005 Girona)
• status: asegues diu comprarà peces (2024-04-02)
• recopilar: transformador(220V-24V), cables i endolls per muntatge:
  

• Comentar amb rdiaz
• Comentar amb vacuña (li sembla bé)

• apedregal contacta autors per compilar només app de terminal
• els autors responen que no enviaran el codi
• [2024-04-19] singularity pull docker://mtapiio/wine8 funciona
• [2024-04-19] instalar dins del cluster
• [2024-04-25] apedregal i dmercado fan proves i em diuen algo

• Reunió 26ABR 9h (jcomas, isegirona, lbosch) a icra
• reunió 16MAI (el PLC serà siemens o omron)
  exemple codi JS amb llibreria "modbus-serial"

                      //LLEGIR PLC
                      const Modbus = require('modbus-serial');
  
                      //nueva conexión Modbus TCP
                      const client = new Modbus();
                      const ip = '192.168.1.100'; // Dirección IP del PLC Siemens
                      const port = 502; // Puerto Modbus TCP del PLC Siemens
  
                      //conecta al PLC
                      client.connectTCP(ip,{port}).then(()=>{
                        console.log('Conexión exitosa al PLC');
  
                        //lee una variable del PLC (ejemplo: registro 1000)
                        client.readHoldingRegisters(1000,1).then((data)=>{
                          console.log('Valor de la variable en el registro 1000:', data.data);
                        }).catch((error) => {
                          console.error('Error al leer la variable:', error);
                        }).finally(() => {
                          client.close(); // Cierra la conexión después de leer
                        });
                      }).catch((error) => {
                        console.error('Error al conectar al PLC:', error);
                      });
                    

                      //ESCRIURE AL PLC
                      const Modbus = require('modbus-serial');
  
                      //nueva conexión Modbus TCP
                      const client = new Modbus();
  
                      const ip = '192.168.1.100'; // Dirección IP del PLC Siemens
                      const port = 502; // Puerto Modbus TCP del PLC Siemens
  
                      //conecta al PLC
                      client.connectTCP(ip, { port })
                        .then(() => {
                          console.log('Conexión exitosa al PLC');
  
                          const addressToWrite = 2000; // Dirección del registro para escribir (ajusta según tu configuración)
                          const valueToWrite = 1; // Valor para encender el dispositivo (por ejemplo, 1 para encender)
  
                          // Escribe el valor en el registro del PLC
                          client.writeRegisters(addressToWrite, [valueToWrite])
                            .then(() => {
                              console.log('Valor escrito correctamente en el PLC');
                            })
                            .catch((error) => {
                              console.error('Error al escribir en el PLC:', error);
                            })
                            .finally(() => {
                              client.close(); // Cierra la conexión después de escribir
                            });
                        })
                        .catch((error) => {
                          console.error('Error al conectar al PLC:', error);
                        });
                    

• reunió per dissenyar web

• noves (706 a 719)
• (lide mirarà) falta confirmar el "Naphrax" FDS-706.pdf
• noves (720 a 749)

• preguntar status [2024-07-15] peticionari descripcio

• oliu compra aparell BLE/ANT+
• script de python que alimenti sqlite i jo faig web

• Obj.2. Gestió de dades biofísiques i socioeconòmiques: Recollir, validar, tractar i emmagatzemar dades biofísiques i socioeconòmiques rellevants per a millorar la precisió i actualització dels models de valorització dels serveis recreatius i estètics dels paisatges fluvials.
• Obj. 5: Sistema d’ajuda a la presa de decisions (SAD): Millorar la usabilitat i accessibilitat del SAD per a usuaris no especialitzats. Assegurar que el SAD compleixi amb els requisits específics per a la proposta d'estratègies basades en objectius ambientals i la seva avaluació socioeconòmica

• kaiju (https://github.com/bioinformatics-centre/kaiju)
• centrifuge (https://github.com/DaehwanKimLab/centrifuge/releases)
• instalar firefox i chrome al cluster
• pcolman fa prova i em diu si tot ok

[root][~]# cat /proc/sys/vm/max_map_count
65530
[root][~]# sysctl vm.max_map_count=262144
[root][~]# cat /proc/sys/vm/max_map_count
262144


• spades
• quast.py
• fastQC
• trimmomatic
• ncbi-genome-download
• agnostos
• pcolman fa prova i em diu si tot ok